Les Apicomplexa sont des parasites intracellulaires obligatoires: ils doivent vivre à l'intérieur d'une cellule pour survivre.
Le phylum des Apicomplexa inclut de nombreux autres pathogènes d'importance médicale ou vétérinaire, parmi lesquels Plasmodium falciparum, responsable de la malaria chez l'humain.
Les Apicomplexa sont des organismes unicellulaires tous parasites de métazoaires; ils ne possèdent pas de flagelle sauf à certains moments du cycle vital.
T. gondii est un eucaryote unicellulaire haplo?de, qui présente certaines caractéristiques conservées chez tous les eucaryotes, mais également des organites spécifiques de son groupe, les Alveolata, ou de son phylum, les Apicomplexa.